RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462063.1

CCDC30-204, Transcript of coiled-coil domain containing 30, human

TSL 3

Gene CCDC30, Length 362 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC30-204	ENST00000462063	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	FGD4	Q96M96	766 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	HAUS7	Q99871	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063		B2RBV5	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	OVOL3	O00110	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	MATN3	O15232	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF205	O95201	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	BMP8B	P34820	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ADAM17	P78536	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ARID5A	Q03989	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	GML	Q99445	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	GSN	P06396	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ITGA4	P13612	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	CNR2	P34972	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC30-204	ENST00000462063	VAMP4	O75379	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	GSTM1	P09488	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	CAP1	Q01518	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A087WZG4	1122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A1W2PQ27	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A1W2PQ64	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A1W2PQC6	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A1W2PQD8	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	IFNGR1	P15260	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	FOXO4	P98177	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	WHRN	Q9P202	907 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063		A0A1W2PQY0	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	CD3E	P07766	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	HMGA2	P52926	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	NR1I3	Q14994	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-204	ENST00000462063	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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