RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNC2Q96PR1 638 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 CTSWP56202 376 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 AMPD2Q01433 879 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 GRB10Q13322 594 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 VHLLQ6RSH7 139 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 SEPHS1P49903 392 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-204ENST00000461653 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 PFKLP17858 780 aa6.9□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 C20orf173Q96LM9 149 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.9□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 F8W031 263 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 SASH1O94885 1247 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 PWWP2AQ96N64 755 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS20P59510 1910 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 LIMS1P48059 325 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 AKT3Q9Y243 479 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 GLI4P10075 376 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 FBLN1P23142 703 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR5P85299 388 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 CABP7Q86V35 215 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 B8ZZF3 427 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 PAMP19021 973 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 SP8Q8IXZ3 490 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 LZTR1Q8N653 840 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.86□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 NAT2P11245 290 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 NCANO14594 1321 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 PRRG2O14669 202 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 NCAPHQ15003 741 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 BVESQ8NE79 360 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPN10Q9HC96 672 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ATF2P15336 505 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 CAP1Q01518 475 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 SCRN1Q12765 414 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 NETO2Q8NC67 525 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 ALG3Q92685 438 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 RELTQ969Z4 430 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 MTA3Q9BTC8 594 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF38Q9H0F5 515 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC1BQ9P126 229 aa6.84□□□□□ -1.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 COPS5Q92905 334 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-204ENST00000461653 C7orf72A4D263 438 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 NPHS1O60500 1241 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 ASGR2P07307 311 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 NCAM1P13591 858 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 MC3RP41968 323 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXO4P98177 505 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.83□□□□□ -1.32
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