RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	RFC2	P35250	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CLUL1	Q15846	466 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CERS3	Q8IU89	383 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	MRS2	Q9HD23	443 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	RGS20	O76081	388 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	MYL3	P08590	195 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CRBN	Q96SW2	442 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SWAP70	Q9UH65	585 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	TMEM221	A6NGB7	291 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667		M0R296	226 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	GPNMB	Q14956	572 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	EDA	Q92838	391 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PDZK1-204	ENST00000443667	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	PRKAB2	O43741	272 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	IGSF3	O75054	1194 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	ZBED4	O75132	1171 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	KRT37	O76014	449 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	GJB5	O95377	273 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	CDK8	P49336	464 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	LCORL	Q8N3X6	602 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	RAD9A	Q99638	391 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	LCT	P09848	1927 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667		E9PSI1	815 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667		H0Y858	1186 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	ATP2A1	O14983	1001 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	NDUFB10	O96000	172 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	GNAI3	P08754	354 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	CCDC17	Q96LX7	622 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	PRRX2	Q99811	253 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	ARMT1	Q9H993	441 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
PDZK1-204	ENST00000443667	TLR9	Q9NR96	1032 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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