RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.6□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 MYH7BA7E2Y1 1941 aa12.6□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 A0A087WWV3 80 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 C2orf72A6NCS6 295 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 USP17L10C9JJH3 530 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 ADAMTS3O15072 1205 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 BMP3P12645 472 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 STAT6P42226 847 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 SEMA3FQ13275 785 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 MORC3Q14149 939 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 E2F4Q16254 413 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM266Q2M3C6 531 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 PAGE5Q96GU1 130 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 AMNQ9BXJ7 453 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 DISC1Q9NRI5 854 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 RMND1Q9NWS8 449 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 A0A087X0B3 334 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 NFKBIEO00221 500 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 CBFA2T2O43439 604 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFB10O96000 172 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 SLC16A2P36021 539 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 IKQ13123 557 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 AP3B2Q13367 1082 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 QRICH1Q2TAL8 776 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 SPC24Q8NBT2 197 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 PSTPIP2Q9H939 334 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 BCS1LQ9Y276 419 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-202ENST00000395322 WNT10BO00744 389 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 FOXN1O15353 648 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SLURP2P0DP57 97 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 AFMP43652 599 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 DPYDQ12882 1025 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 MMRN1Q13201 1228 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 IL17AQ16552 155 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CALCRLQ16602 461 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SYDE2Q5VT97 1194 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 ISM2Q6H9L7 571 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 BTNL9Q6UXG8 535 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SIAH1Q8IUQ4 282 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 GINM1Q9NU53 330 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TMX2Q9Y320 296 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM232C9JQI7 657 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R37O75864 691 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 ASNSP08243 561 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 STAT2P52630 851 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 NCAPHQ15003 741 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO11Q86XK2 927 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 DPF2Q92785 391 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CALML4Q96GE6 196 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM260Q9NX78 707 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CAP2P40123 477 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 GSDMDP57764 484 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 MAP3K10Q02779 954 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CABP7Q86V35 215 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM39BQ9GZU3 492 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PLA2G6O60733 806 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 FOSP01100 380 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 USP11P51784 963 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 NBPF9Q3BBW0 867 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 MOXD1Q6UVY6 613 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 FAM160B2Q86V87 743 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 IGSF22Q8N9C0 903 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 CHURC1Q8WUH1 139 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 HOOK2Q96ED9 719 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 VCPKMTQ9H867 229 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 DOCK1Q14185 1865 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 FZD9O00144 591 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 SLC26A4O43511 780 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-202ENST00000395322 NRDCO43847 1150 aa12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms