RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
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PGGT1B-202ENST00000379615 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 CNGA1P29973 690 aa17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 GJA8P48165 433 aa17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB118Q96PH6 123 aa17.78■□□□□ 0.44
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYBAP13498 195 aa17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 NEK4P51957 841 aa17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 DNERQ8NFT8 737 aa17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa17.77■□□□□ 0.44
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PGGT1B-202ENST00000379615 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa17.76■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 hCG_1984214I3L0E3 225 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CPLX1O14810 134 aa17.76■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDC27P30260 824 aa17.76■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMCX2Q7L311 632 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 IL27Q8NEV9 243 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 NID2Q14112 1375 aa17.76■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SEPT4O43236 478 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 GHRHRQ02643 423 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 FGD4Q96M96 766 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD17B4P51659 736 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CCT2P78371 535 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 FUT2Q10981 343 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ACVR2BQ13705 512 aa17.74■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM184BQ9ULE4 1060 aa17.74■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKL5O76039 1030 aa17.73■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 AK2P54819 239 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE4DQ08499 809 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPV1Q8NER1 839 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 MORC4Q8TE76 937 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D5Q92609 795 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 IWS1Q96ST2 819 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RMDN3Q96TC7 470 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 VTA1Q9NP79 307 aa17.73■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPFP49454 3210 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 OPLAHO14841 1288 aa17.72■□□□□ 0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RARBP10826 455 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKLE1Q8NAG6 615 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 OGDHLQ9ULD0 1010 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SCG2P13521 617 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 NAPAP54920 295 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 STK3Q13188 491 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RABEP1Q15276 862 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 LHX8Q68G74 356 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ARRDC4Q8NCT1 418 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TAAR1Q96RJ0 339 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 BARHL2Q9NY43 387 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.71■□□□□ 0.43
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