RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369215.4

PRDM13-202, Transcript of PR/SET domain 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM13, Length 2,429 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM13-202ENST00000369215 FAM83AQ86UY5 434 aa26.56■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 CTIFO43310 598 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 JDP2Q8WYK2 163 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 AMNQ9BXJ7 453 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 CCZ1BP86790 482 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 VSTM4Q8IW00 320 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 TBC1D12O60347 775 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 SKILP12757 684 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 STX17P56962 302 aa26.54■■□□□ 1.84
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PRDM13-202ENST00000369215 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.54■■□□□ 1.84
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PRDM13-202ENST00000369215 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 TNNT1P13805 278 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 FBXO11Q86XK2 927 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 CALML4Q96GE6 196 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 RAB34Q9BZG1 259 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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PRDM13-202ENST00000369215 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L11C9JVI0 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L18D6R9N7 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L22D6RA61 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L19D6RCP7 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L20D6RJB6 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L24Q0WX57 530 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 KCNB1Q14721 858 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 INTS13Q9NVM9 706 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 TMX2Q9Y320 296 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 ECE1P42892 770 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 SNAP25P60880 206 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 SEMA3FQ13275 785 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 WNT10BO00744 389 aa26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 PDIA5Q14554 519 aa26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 TNIP1Q15025 636 aa26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 GOPCQ9HD26 462 aa26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.51■■□□□ 1.84
PRDM13-202ENST00000369215 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 ACER1Q8TDN7 264 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 NFKBIEO00221 500 aa26.5■■□□□ 1.83
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PRDM13-202ENST00000369215 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 MCTP2Q6DN12 878 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 ANO3Q9BYT9 981 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 KLRC4O43908 158 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 PAK1Q13153 545 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.5■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 GDAQ9Y2T3 454 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 MEIS2O14770 477 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 RHOBTB3O94955 611 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 MMP14P50281 582 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 USP11P51784 963 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 USH1GQ495M9 461 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 SHTN1A0MZ66 631 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 STAT2P52630 851 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 AMPD3Q01432 767 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 GRB10Q13322 594 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 NELFBQ8WX92 580 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 HAS1Q92839 578 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 STK17AQ9UEE5 414 aa26.48■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 CAP2P40123 477 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 PRCPP42785 496 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 ANKRD7Q92527 254 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 TRIM9Q9C026 710 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 A0A1B0GTH6 734 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 POTEMA6NI47 508 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 NRDCO43847 1150 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 MARCH6O60337 910 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 MAP3K10Q02779 954 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 NR1I3Q14994 352 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 KRT79Q5XKE5 535 aa26.46■■□□□ 1.83
PRDM13-202ENST00000369215 ADSSL1Q8N142 457 aa26.46■■□□□ 1.83
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