RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 SBF2Q86WG5 1849 aa26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 NEK8Q86SG6 692 aa26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 SAR1BQ9Y6B6 198 aa26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 MYH10P35580 1976 aa26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.4■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 POTEB2H3BUK9 544 aa26.39■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 TAF3Q5VWG9 929 aa26.39■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.39■■□□□ 1.82
PINK1-201ENST00000321556 PSMD14O00487 310 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ZNF263O14978 683 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 TUBB2AQ13885 445 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 C6orf50Q9HD87 102 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SNED1Q8TER0 1413 aa26.39■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 POTEMA6NI47 508 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 FAM193AP78312 1265 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GPSM2P81274 684 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SOGA3Q5TF21 947 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SLC37A4O43826 429 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 TDP2O95551 362 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 PRPHP41219 470 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 LRRC41Q15345 812 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 PSMB7Q99436 277 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 MYMKA6NI61 221 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 IDEP14735 1019 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GRAPQ13588 217 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 MEA1Q16626 185 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GALNT17Q6IS24 598 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 C8orf37Q96NL8 207 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 JADE2Q9NQC1 790 aa26.37■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 UFL1O94874 794 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GSTO1P78417 241 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 PICALMQ13492 652 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 LAD1O00515 517 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SLURP2P0DP57 97 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 PPP4CP60510 307 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GRB10Q13322 594 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CAGE1Q8TC20 777 aa26.36■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 KRT86O43790 486 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 KRT83P78385 493 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ZBED6P86452 979 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GPS2Q13227 327 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 RFC4P35249 363 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 C2orf54Q08AI8 447 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 BICDL2A1A5D9 508 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 USP14P54578 494 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CCDC96Q2M329 555 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 KCNK18Q7Z418 384 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CALML4Q96GE6 196 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CD209Q9NNX6 404 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 MYL1P05976 194 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 MYBL2P10244 700 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 GNA11P29992 359 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ZSCAN26Q16670 478 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 AK8Q96MA6 479 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 PNMA5Q96PV4 448 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.34■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 F8W031 263 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 EDIL3O43854 480 aa26.33■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.33■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 LDHCP07864 332 aa26.33■■□□□ 1.81
PINK1-201ENST00000321556 CALCRLQ16602 461 aa26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms