RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316824.3

ALX1-201, Transcript of ALX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALX1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1-201ENST00000316824 ATG4CQ96DT6 458 aa14.94□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.94□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MEIS2O14770 477 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ADAMTS3O15072 1205 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CUTAO60888 179 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 POLR2MP0CAP2 368 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ATP2B1P20020 1258 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 GHRHRQ02643 423 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 UBE2SQ16763 222 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 TKFCQ3LXA3 575 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 LBX2Q6XYB7 198 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 WNK4Q96J92 1243 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PGBD1Q96JS3 809 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.93□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 OPLAHO14841 1288 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 GTF2A2P52657 109 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 TREML2Q5T2D2 321 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 REPS2Q8NFH8 660 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ANO3Q9BYT9 981 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 TMEM260Q9NX78 707 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PNMA3Q9UL41 463 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 NEMFO60524 1076 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CETPP11597 493 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 OSBPP22059 807 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PTPREP23469 700 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MCM7P33993 719 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 LETM2Q2VYF4 491 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ALAS1P13196 640 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CMA1P23946 247 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 GJA5P36382 358 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 SREBF1P36956 1147 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PRPHP41219 470 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 HSD17B4P51659 736 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 USP11P51784 963 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PTGDRQ13258 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ZNF174Q15697 407 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CPXCR1Q8N123 301 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 PASKQ96RG2 1323 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 WNT7AO00755 349 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CFBP00751 764 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 COPB2P35606 906 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 MOGSQ13724 837 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CST9Q5W186 159 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 FSIP1Q8NA03 581 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.9□□□□□ -0.02
ALX1-201ENST00000316824 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 OR52Z1P0C646 297 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 HUNKP57058 714 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 ARHGAP4P98171 946 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 GSE1Q14687 1217 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 SPRYD7Q5W111 196 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 RESP18Q5W5W9 173 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 ACAD9Q9H845 621 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 RNF146Q9NTX7 359 aa14.89□□□□□ -0.03
ALX1-201ENST00000316824 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms