RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ADALQ6DHV7 355 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBPP22059 807 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 LBX2Q6XYB7 198 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 NFIBO00712 420 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 HERVK_113P62684 666 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGDRQ13258 359 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CCL15Q16663 113 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF146Q9NTX7 359 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQ27 194 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQ64 194 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQD8 194 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 STAT3P40763 770 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 PLS1Q14651 629 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 TKFCQ3LXA3 575 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA3Q9UL41 463 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-201ENST00000298838 HSD17B4P51659 736 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 GHRHRQ02643 423 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D5Q92609 795 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CUTAO60888 179 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 TOMM70O94826 608 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPREP23469 700 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 FERMT2Q96AC1 680 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RIPK3Q9Y572 518 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 LAD1O00515 517 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 NEMFO60524 1076 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SREBF1P36956 1147 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 USP11P51784 963 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP4P98171 946 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RGMBQ6NW40 437 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 FSIP1Q8NA03 581 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ACAD9Q9H845 621 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 BTBD7Q9P203 1132 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 TDP2O95551 362 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CMA1P23946 247 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CLIC6Q96NY7 704 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 BTBD19C9JJ37 291 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PDHXO00330 501 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 EDIL3O43854 480 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 LIG1P18858 919 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 NSMFQ6X4W1 530 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 OR52Z1P0C646 297 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPHP41219 470 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CHST13Q8NET6 341 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 MAF1Q9H063 256 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-201ENST00000298838 SHC4Q6S5L8 630 aa23.52■■□□□ 1.36
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