RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 C2orf54Q08AI8 447 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 SELENOOQ9BVL4 669 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 PLCG1P19174 1290 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 GGCXP38435 758 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 PRPHP41219 470 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 MIIPQ5JXC2 388 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 TSPY3P0CV98 308 aa28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 TSPY8P0CW00 308 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 STK4Q13043 487 aa28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 IQCEQ6IPM2 695 aa28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 SETDB2Q96T68 719 aa28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM9Q9C026 710 aa28.15■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 MAGEF1Q9HAY2 307 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 BARGINQ6ZT62 677 aa28.14■■■□□ 2.1
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CTBP1-201ENST00000290921 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.14■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 TSGA10Q9BZW7 698 aa28.14■■■□□ 2.1
CTBP1-201ENST00000290921 A0A1W2PQJ5 194 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 SPA17Q15506 151 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 FIGNQ5HY92 759 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF263O14978 683 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 ASIC1P78348 528 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 AGPSO00116 658 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 FCER1AP12319 257 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 TXNRD1Q16881 649 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 MTMR7Q9Y216 660 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 PPFIA4O75335 1185 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC96Q2M329 555 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC70Q6NSX1 233 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 C7orf25Q9BPX7 421 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 SNX12Q9UMY4 172 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 AK8Q96MA6 479 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 JRKLQ9Y4A0 524 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.094e-7■■■□□ 15.7
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CTBP1-201ENST00000290921 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 CREG2Q8IUH2 290 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM58Q8NG06 486 aa28.11■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 STX8Q9UNK0 236 aa28.11■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.1■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.1■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 TACC1O75410 805 aa28.09■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.09■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa28.09■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa28.09■■■□□ 2.09
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CTBP1-201ENST00000290921 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 MAGEA9P43362 315 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 SH2D4AQ9H788 454 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 BAG3O95817 575 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 RASA1P20936 1047 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-201ENST00000290921 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.08■■■□□ 2.09
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