RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 NT5C2P49902 561 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 VPS52Q8N1B4 723 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 NME8Q8N427 588 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 IFT81Q8WYA0 676 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 DNAI1Q9UI46 699 aa14.91□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A0G2JLW4 131 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA24Q86W54 205 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM107BQ9H098 131 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 COX16Q9P0S2 106 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MICALL2Q8IY33 904 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 YAF2Q8IY57 180 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 IVLP07476 585 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MARK3P27448 753 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MAP7Q14244 749 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 CIITAP33076 1130 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 JAK3P52333 1124 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 SNAPC2Q13487 334 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 GBP6Q6ZN66 633 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 ELP3Q9H9T3 547 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 MBD5Q9P267 1494 aa14.9□□□□□ -0.02
PDGFRB-201ENST00000261799 WDR64B1ANS9 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 GH2P01242 217 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ASB14A6NK59 587 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ADD2P35612 726 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CDK8P49336 464 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 PIGSQ96S52 555 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TET3O43151 1660 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 FGAP02671 866 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 NLRP12P59046 1061 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CYP4A11Q02928 519 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 KCNA4P22459 653 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TIGD1Q96MW7 591 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ABCC4O15439 1325 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 F8W8V4 182 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 VAV2P52735 878 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 GPSM2P81274 684 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM81BQ96LP2 452 aa14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 MFAP3P55082 362 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 BPIFB4P59827 614 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ARMCX2Q7L311 632 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM206Q9H813 350 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 MED7O43513 233 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ADGRB3O60242 1522 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CHRNA5P30532 468 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 STAT1P42224 750 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 MYL7Q01449 175 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF139Q8WU17 664 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L15C9J2P7 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L11C9JVI0 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L18D6R9N7 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L22D6RA61 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L19D6RCP7 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L20D6RJB6 530 aa14.88□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms