RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 EBF2Q9HAK2 575 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 INCENPQ9NQS7 918 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 EXOC1Q9NV70 894 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 LMTK3Q96Q04 1460 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ENO4A6NNW6 628 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ANP32DO95626 131 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SRGNP10124 158 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 GHRP10912 638 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 LIFRP42702 1097 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CASP7P55210 303 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RETREG2Q8NC44 543 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TCP11Q8WWU5 503 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 UBAC1Q9BSL1 405 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CEP126Q9P2H0 1117 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CLTAP09496 248 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ADORA1P30542 326 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SCARF1Q14162 830 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF174Q15697 407 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TRIM47Q96LD4 638 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 C5orf60A6NFR6 353 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PPIP5K2O43314 1243 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RWDD2BP57060 319 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF790Q6PG37 636 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RAPGEF5Q92565 580 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 KRT12Q99456 494 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 MTRQ99707 1265 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.139e-6■□□□□ 8.3
CSDE1-201ENST00000261443 THAP9Q9H5L6 903 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RASSF10A6NK89 507 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 AP1G2O75843 785 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 BMP15O95972 392 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PDE6BP35913 854 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PPP2R2AP63151 447 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CDK17Q00537 523 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PI16Q6UXB8 463 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CCDC63Q8NA47 563 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TLR10Q9BXR5 811 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 21.1
CSDE1-201ENST00000261443 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.99□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 AKR1B10O60218 316 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TRIM37O94972 964 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 HSD17B3P37058 310 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 DNA2P51530 1060 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 KIF11P52732 1056 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 BIRC3Q13489 604 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SLMAPQ14BN4 828 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TRADDQ15628 312 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ADSSL1Q8N142 457 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 RNF14Q9UBS8 474 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 ZPR1O75312 459 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 XBP1P17861 261 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CDC25CP30307 473 aa7.98□□□□□ -1.13
CSDE1-201ENST00000261443 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms