RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 MYBP10242 640 aa20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 STAMQ92783 540 aa20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 SHISA4Q96DD7 197 aa20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 SH3GL3Q99963 347 aa20.42■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 GLI3P10071 1580 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 H0YGN5 161 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 ADCY2Q08462 1091 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 QPCTQ16769 361 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 TNFRSF25Q93038 417 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 HVCN1Q96D96 273 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 POLD4Q9HCU8 107 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 NFS1Q9Y697 457 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 B4DLN1 442 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 MYZAPP0CAP1 466 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 GUCY2DQ02846 1103 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 BIRC2Q13490 618 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 TTI2Q6NXR4 508 aa20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.4■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.4■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.4■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 EHD2Q9NZN4 543 aa20.4■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 MYL1P05976 194 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 TTC38Q5R3I4 469 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 FANCBQ8NB91 859 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.39■□□□□ 0.86
CGRRF1-201ENST00000216420 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PSMA7O14818 248 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF11P52732 1056 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 WTAPQ15007 396 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MSL1Q68DK7 614 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.39■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 OPLAHO14841 1288 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ORC4O43929 436 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CXCR5P32302 372 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP2R2AP63151 447 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 IFT81Q8WYA0 676 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM47Q96LD4 638 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 WNT7AO00755 349 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 DRD4P21917 467 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAPPC10P48553 1259 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 GUCY2FP51841 1108 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PTGDRQ13258 359 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PKN1Q16512 942 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ACCSLQ4AC99 568 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RAPGEF5Q92565 580 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CENPTQ96BT3 561 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ISCUQ9H1K1 167 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.38■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 RHOBTB3O94955 611 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 GCKP35557 465 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MCAMP43121 646 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC45Q96CN5 670 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 NOX5Q96PH1 765 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SWAP70Q9UH65 585 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 EID1Q9Y6B2 187 aa20.37■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP73A6NFT4 308 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 KLK7P49862 253 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 TCIRG1Q13488 830 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 CUL1Q13616 776 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF174Q15697 407 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 MIIPQ5JXC2 388 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 PI16Q6UXB8 463 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 C14orf37Q86TY3 774 aa20.36■□□□□ 0.85
CGRRF1-201ENST00000216420 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms