RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxn3Q499D0 457 aa22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tshz1Q5DTH5 1084 aa22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pnma5Q5DTT8 618 aa22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem63cQ8CBX0 802 aa22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ano2Q8CFW1 1002 aa22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt79Q8VED5 531 aa22.16■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atrnl1Q6A051 1378 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp17ldG5E8G2 545 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp17lcG5E8I7 545 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcif1P59114 706 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prr7Q3V0I2 269 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exoc1Q8R3S6 894 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arl8aQ8VEH3 186 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BaatQ91X34 420 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vav3Q9R0C8 847 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bpifb4A2BGH0 617 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt1a8D3Z748 530 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt1a10E9PXN7 530 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Man1a2P39098 641 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CtshP49935 333 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Setd4P58467 439 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exoc8Q6PGF7 716 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Frmd3Q8BHD4 595 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ifih1Q8R5F7 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kremen1Q99N43 473 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp21Q9QZL6 566 aa22.15■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SynrgQ5SV85 1306 aa22.14■■□□□ 1.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AoahO35298 574 aa22.14■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem134Q8R0J4 195 aa22.14■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ifi202Q9R002 445 aa22.14■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NynrinQ5DTZ0 1840 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdc25aP48964 514 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr832Q7TRG9 312 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igdcc3Q8BQC3 813 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plcg2Q8CIH5 1265 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Frat2Q8K025 231 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spire2Q8K1S6 718 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CenpqQ9CPQ5 267 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Efhd1Q9D4J1 240 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NapaQ9DB05 295 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcb6Q9DC29 842 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Elf2Q9JHC9 593 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AmfrQ9R049 643 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5737A0A140LI11 423 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stat3P42227 770 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acot10Q32MW3 439 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmd1Q3TXS7 953 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc2a13Q3UHK1 637 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bag1Q60739 355 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxa13Q62424 386 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpr150Q8BL07 427 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5934D3Z4U6 212 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igbp1Q61249 340 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thap3Q8BJ25 218 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dcaf8Q8N7N5 591 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HyiQ8R1F5 277 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bst2Q8R2Q8 172 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mkrn1Q9QXP6 481 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc26a4Q9R155 780 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vstm4T1NXB5 319 aa22.12■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Card6E9PWH2 1175 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8C5C9 218 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mfap3lQ9D3X9 409 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mageb2A2AHM0 380 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Samsn1P57725 372 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lgr6Q3UVD5 967 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp13a3Q5XF89 1219 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 F11Q91Y47 624 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GrapQ9CX99 217 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Desi2Q9D291 194 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubiad1Q9DC60 336 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfand4D3Z3C6 739 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc121E9Q6D3 323 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rad51bO35719 350 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mpp3O88910 568 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Magea6O89010 325 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ms4a1P19437 291 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wnt10bP48614 389 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Siah1bQ06985 282 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trpc6Q61143 930 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stxbp2Q64324 593 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Magea3Q6T340 320 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Jade2Q6ZQF7 829 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nek9Q8K1R7 984 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Otud6bQ8K2H2 294 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.8 ms