RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LIG1P18858 919 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 RLFQ13129 1914 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF536O15090 1300 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 UNCXA6NJT0 531 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MEIS2O14770 477 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OPLAHO14841 1288 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FDX1P10109 184 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF6O14896 467 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ICAM1P05362 532 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TBCKQ8TEA7 893 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OTUD5Q96G74 571 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L15C9J2P7 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L11C9JVI0 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L18D6R9N7 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L22D6RA61 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L19D6RCP7 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L20D6RJB6 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL11O14625 94 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CUTAO60888 179 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPREP23469 700 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L24Q0WX57 530 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIL2Q13356 520 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK8Q86SG6 692 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB11O95342 1321 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SMCHD1A6NHR9 2005 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MCTP2Q6DN12 878 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CMA1P23946 247 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 DSG3P32926 999 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MCM7P33993 719 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP1BP68106 108 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGDRQ13258 359 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 COG2Q14746 738 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FSIP1Q8NA03 581 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3CDO00329 1044 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA5AO00534 786 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED4O75132 1171 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 AP3B2Q13367 1082 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 OPTNQ96CV9 577 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG4CQ96DT6 458 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CLIC6Q96NY7 704 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CCPG1Q9ULG6 757 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MYPNQ86TC9 1320 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ENGASEQ8NFI3 743 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 DACT1Q9NYF0 836 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PNMA2Q9UL42 364 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 EDIL3O43854 480 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1I2O75469 434 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 LETM2Q2VYF4 491 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC183Q5T5S1 534 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SHC4Q6S5L8 630 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
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CAPNS1-215ENST00000628018 TREML2Q5T2D2 321 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 REPS2Q8NFH8 660 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FERMT2Q96AC1 680 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 WNK4Q96J92 1243 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GVL5 298 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIN1Q05586 938 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM160A1Q05DH4 1040 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RESP18Q5W5W9 173 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CPXCR1Q8N123 301 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ANO3Q9BYT9 981 aa28.33■■■□□ 2.13
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