RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 EP400Q96L91 3159 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SRGNP10124 158 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 BRD3Q15059 726 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MEA1Q16626 185 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CABP7Q86V35 215 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LAD1O00515 517 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 OR52Z1P0C646 297 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GYS2P54840 703 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 VSNL1P62760 191 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LETM2Q2VYF4 491 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MYL1P05976 194 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RHBDL3P58872 404 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 FAM193AP78312 1265 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 POTEDQ86YR6 584 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB9Q96C00 473 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 EYA3Q99504 573 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM260Q9NX78 707 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NOVP48745 357 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NAPAP54920 295 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CEP95Q96GE4 821 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ENC1O14682 589 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PSMA7O14818 248 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NT5C2P49902 561 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 P2RX5Q93086 422 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PIGSQ96S52 555 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ABCB6Q9NP58 842 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SMCO2A6NFE2 343 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PSMD14O00487 310 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 BAG3O95817 575 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TECP42680 631 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 GSTO1P78417 241 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 VPS72Q15906 364 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 MYO6Q9UM54 1294 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L5A8MUK1 530 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PDE4DQ08499 809 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TUBB2AQ13885 445 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NEK11Q8NG66 645 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TBCKQ8TEA7 893 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 AK8Q96MA6 479 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CD209Q9NNX6 404 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC1Q9NV70 894 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 L1RE1Q9UN81 338 aa14.96□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CCNE1P24864 410 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GRB10Q13322 594 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NEK8Q86SG6 692 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF263O14978 683 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SLC37A4O43826 429 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PNMA5Q96PV4 448 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MTMR9Q96QG7 549 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CUEDC2Q9H467 287 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 EPHB6O15197 1021 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SRGAP2O75044 1071 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 DNM2P50570 870 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms