RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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SMAD4-210ENST00000590061 NYAP2Q9P242 653 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 TNKSO95271 1327 aa8.51□□□□□ -1.05
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SMAD4-210ENST00000590061 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.48□□□□□ -1.05
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SMAD4-210ENST00000590061 GMCL1Q96IK5 515 aa8.48□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 TEPSINQ96N21 525 aa8.48□□□□□ -1.05
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SMAD4-210ENST00000590061 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.47□□□□□ -1.05
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SMAD4-210ENST00000590061 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 ME3Q16798 604 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT17Q6IS24 598 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.47□□□□□ -1.05
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