RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, human

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-215	ENST00000546102	ATE1	O95260	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	B3GALT4	O96024	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	CTSB	P07858	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	FUT4	P22083	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	ARNT	P27540	789 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	STAT3	P40763	770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	NFKB2	Q00653	900 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	BNIP3	Q12983	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	UBR7	Q8N806	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL3-215	ENST00000546102	ATP10A	O60312	1499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CD8B	P10966	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CDK8	P49336	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102		E9PCH4	1651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102		A0A087X0B3	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ADCY3	O60266	1144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SUSD5	O60279	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PDE8A	O60658	829 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	HTR3B	O95264	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ECEL1	O95672	775 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	L1CAM	P32004	1257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SOX5	P35711	763 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RHBDL3	P58872	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ID3	Q02535	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	AOC3	Q16853	763 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CEP152	O94986	1710 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ABCC3	O15438	1527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CEACAM5	P06731	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LIG1	P18858	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	NCAPH	Q15003	741 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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