RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529558.1

AMBRA1-208, Transcript of autophagy and beclin 1 regulator 1, human

TSL 5

Gene AMBRA1, Length 483 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AMBRA1-208	ENST00000529558	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GAS6	Q14393	721 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ISL2	Q96A47	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558		M0R082	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ARVCF	O00192	962 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GAS7	O60861	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	VAMP4	O75379	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	LRIG2	O94898	1065 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PF4V1	P10720	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PHKG2	P15735	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GRIK1	P39086	918 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	HTR3A	P46098	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	NEK3	P51956	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	KRT85	P78386	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	OCRL	Q01968	901 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PICALM	Q13492	652 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GBX1	Q14549	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68	2e-7	■□□□□ 8.3
AMBRA1-208	ENST00000529558	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMBRA1-208	ENST00000529558	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	ERC2	O15083	957 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	MT-CO1	P00395	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	CFB	P00751	764 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	LTF	P02788	710 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	CKM	P06732	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	RBP3	P10745	1247 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	EPX	P11678	715 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	ADH5	P11766	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	ITIH2	P19823	946 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	SESN3	P58005	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	GPR85	P60893	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	AMPD2	Q01433	879 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMBRA1-208	ENST00000529558	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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