RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524048.1

HOXA-AS2-210, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA-AS2, Length 493 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CDH23Q9H251 3354 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 F5H6K3 240 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 APPP05067 770 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 COPB2P35606 906 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 KLRC3Q07444 240 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SNX17Q15036 470 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CEP95Q96GE4 821 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PHF24Q9UPV7 400 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RIPK3Q9Y572 518 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 DLL1O00548 723 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GNAT2P19087 354 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TLE2Q04725 743 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 C9orf50Q5SZB4 431 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CPXCR1Q8N123 301 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 BADQ92934 168 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 KIFC2Q96AC6 838 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FAM161BQ96MY7 647 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FSD1Q9BTV5 496 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 VCANP13611 3396 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 A0A1W2PQY0 241 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZBED4O75132 1171 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TTLL1O95922 423 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 AKR1A1P14550 325 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRR20EP86478 221 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRR20CP86479 221 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRR20DP86480 221 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRR20BP86481 221 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRR20AP86496 221 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SHHQ15465 462 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 RNF180Q86T96 592 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 DDX11Q96FC9 970 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GUCD1Q96NT3 240 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MYH8P13535 1937 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PARP14Q460N5 1801 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MYH7P12883 1935 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ATP2A1O14983 1001 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ERC2O15083 957 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TLL1O43897 1013 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ADAMTS4O75173 837 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TSPY3P0CV98 308 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 TSPY8P0CW00 308 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ITGB8P26012 769 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FGD4Q96M96 766 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NACAP1Q9BZK3 213 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 NAPBQ9H115 298 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 FEM1BQ9UK73 627 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 LTBP2Q14767 1821 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MYADML2A6NDP7 307 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ADCY6O43306 1168 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 CLTBP09497 229 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 MX1P20591 662 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 ACLYP53396 1101 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXA-AS2-210ENST00000524048 EPHB4P54760 987 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms