RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 GMLQ99445 158 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.91□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 RAP1GAPP47736 663 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.9□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.9□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 TOX2Q96NM4 488 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.9□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 RGS12O14924 1447 aa5.9□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 CAP2P40123 477 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 MIPEPQ99797 713 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC3Q9BY71 257 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 FBRSQ9HAH7 460 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC2-216ENST00000523628 PLCH1Q4KWH8 1693 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 ALS2Q96Q42 1657 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA3Q99758 1704 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 H3BS24 57 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 CFPP27918 469 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 HDXQ7Z353 690 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 ORAI2Q96SN7 254 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 STK26Q9P289 416 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJA2O60884 412 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SOX9P48436 509 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 CLCQ05315 142 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 NKG7Q16617 165 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 SEZ6Q53EL9 994 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 C1QL4Q86Z23 238 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC120Q96HB5 630 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 EVC2Q86UK5 1308 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 CPDO75976 1380 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 BCL9LQ86UU0 1499 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 RGPD1P0DJD0 1748 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC2-216ENST00000523628 DISP2A7MBM2 1401 aa5.86□□□□□ -1.47
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