RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496935.1

DENND1B-210, Transcript of DENN domain containing 1B, humanhuman

TSL 2

Gene DENND1B, Length 2,137 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1B-210ENST00000496935 ALS2CLQ60I27 953 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 KAT2BQ92831 832 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PEAK1Q9H792 1746 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 A0A1B0GVL5 298 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 KLHL33A6NCF5 533 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ARAFP10398 606 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CD33P20138 364 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 TNFRSF8P28908 595 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ABL2P42684 1182 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CCT5P48643 541 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 LMNB2Q03252 620 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 STK3Q13188 491 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 MLECQ14165 292 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 SLC39A14Q15043 492 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 BEND3Q5T5X7 828 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CCDC102BQ68D86 513 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 KIAA1328Q86T90 577 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 AACSQ86V21 672 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 SH3GL2Q99962 352 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 MYO6Q9UM54 1294 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NEO1Q92859 1461 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 DIP2BQ9P265 1576 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 SPEF2Q9C093 1822 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 UTYO14607 1347 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.2□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PALLDQ8WX93 1383 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 A0A0D9SFI3 127 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 A0A1W2PNR3 127 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ANO9A1A5B4 782 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NEFHP12036 1026 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ATP1A3P13637 1013 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 FNTAP49354 379 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 AMPD2Q01433 879 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NLRP8Q86W28 1048 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PDILTQ8N807 584 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 C8orf76Q96K31 380 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NBPF4Q96M43 638 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 FAM227BQ96M60 508 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 RUFY1Q96T51 708 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 EPC1Q9H2F5 836 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 VCPKMTQ9H867 229 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 USP54Q70EL1 1684 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PIK3R2O00459 728 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PSMD14O00487 310 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 MFAP3LO75121 409 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CDKL5O76039 1030 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ATP5JP18859 108 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 SPAG1Q07617 926 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 IDI1Q13907 227 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 NR1I3Q14994 352 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 RESP18Q5W5W9 173 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 EMBQ6PCB8 327 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 CD163Q86VB7 1156 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 IQCA1Q86XH1 822 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.19□□□□□ -1.42
DENND1B-210ENST00000496935 DPF2Q92785 391 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1379.5 ms