RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1B0GTL3	188 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952		H0Y8X5	98 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF445	P59923	1031 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	MRS2	Q9HD23	443 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ASGR2	P07307	311 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	GSTM1	P09488	218 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	GLI4	P10075	376 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ITGAE	P38570	1179 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	PRR5	P85299	388 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	APOBR	Q0VD83	1088 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ITGB3	P05106	788 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	NCAM1	P13591	858 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	INSRR	P14616	1297 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF1A	P19438	455 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	ERCC3	P19447	782 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	LNPK	Q9C0E8	428 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TTC3-222	ENST00000491952		A0A087WZG4	1122 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952		K7ESM1	405 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	ADAM17	P78536	824 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	FERMT3	Q86UX7	667 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	CARF	Q8N187	725 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	NKD1	Q969G9	470 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	CD247	P20963	164 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	MC3R	P41968	323 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	GGT7	Q9UJ14	662 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952		F8W031	263 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	IFNGR1	P15260	489 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	MCM4	P33991	863 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	NAT16	Q8N8M0	369 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	TM9SF2	Q99805	663 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	MATN3	O15232	486 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	IMPDH2	P12268	514 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	PML	P29590	882 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	L1CAM	P32004	1257 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	JAML	Q86YT9	394 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF827	Q17R98	1081 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	FIBCD1	Q8N539	461 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	BRF1	Q92994	677 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	GPR20	Q99678	358 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	USP40	Q9NVE5	1235 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PQ27	194 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PQ64	194 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PQC6	194 aa		5.41	□□□□□ -1.54

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