RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 FAM129CQ86XR2 697 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 SPATA32Q96LK8 384 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 A0A087WZG4 1122 aa5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 MSL3P1P0C860 447 aa5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 GINM1Q9NU53 330 aa5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 UNCXA6NJT0 531 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 CYBBP04839 570 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 CD3EP07766 207 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PFKLP17858 780 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 VAMP1P23763 118 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 NCKAP1LP55160 1127 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 CORO7P57737 925 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PAK2Q13177 524 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 BICRALQ6AI39 1079 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PWWP2AQ96N64 755 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.92□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 SRGAP3O43295 1099 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 DBHP09172 617 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 IFNGR1P15260 489 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 L1CAMP32004 1257 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PPP2R5DQ14738 602 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 NFIXQ14938 502 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 VMACQ2NL98 169 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 GNPTABQ3T906 1256 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 WHRNQ9P202 907 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 CBFA2T2O43439 604 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 RECKO95980 971 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 SOX9P48436 509 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 SP8Q8IXZ3 490 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 HAUS7Q99871 368 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 GBP3Q9H0R5 595 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFCD-210ENST00000490205 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 PPM1BO75688 479 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 GIPRP48546 466 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 SLC7A5Q01650 507 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 GPRASP2Q96D09 838 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 A0A1W2PQH9 124 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 F8W031 263 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 AURKAO14965 403 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 SYN1P17600 705 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 TACR1P25103 407 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 CAP1Q01518 475 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 LIMS1P48059 325 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 PRR5P85299 388 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 CABP7Q86V35 215 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 CXorf38Q8TB03 319 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 STXBP3O00186 592 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 VAMP4O75379 141 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 EPHX1P07099 455 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 NCAM1P13591 858 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFCD-210ENST00000490205 SEPHS1P49903 392 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms