RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489487.1

TMEM30CP-202, Transcript of transmembrane protein 30C, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM30CP, Length 380 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CP-202ENST00000489487 PNLIPP16233 465 aa7.35□□□□□ -1.23
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TMEM30CP-202ENST00000489487 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.35□□□□□ -1.23
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TMEM30CP-202ENST00000489487 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.29□□□□□ -1.24
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TMEM30CP-202ENST00000489487 CPP00450 1065 aa7.27□□□□□ -1.25
TMEM30CP-202ENST00000489487 THBDP07204 575 aa7.27□□□□□ -1.25
TMEM30CP-202ENST00000489487 SDHBP21912 280 aa7.27□□□□□ -1.25
TMEM30CP-202ENST00000489487 ECI1P42126 302 aa7.27□□□□□ -1.25
TMEM30CP-202ENST00000489487 BICRALQ6AI39 1079 aa7.27□□□□□ -1.25
TMEM30CP-202ENST00000489487 IQCEQ6IPM2 695 aa7.27□□□□□ -1.25
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