RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488023.1

HFM1-208, Transcript of HFM1, ATP dependent DNA helicase homolog, human

TSL 5

Gene HFM1, Length 1,699 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HFM1-208	ENST00000488023	GIPR	P48546	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023		B2RBV5	119 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	GJB6	O95452	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	DLG4	P78352	724 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	BIRC2	Q13490	618 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HFM1-208	ENST00000488023	HTR3B	O95264	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CELA3B	P08861	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TCEA2	Q15560	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	KCNQ2	O43526	872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CREB3	O43889	395 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TRIM13	O60858	407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	MLEC	Q14165	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	UBR7	Q8N806	425 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	PEX10	O60683	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	SEMA7A	O75326	666 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ZNF165	P49910	485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	LRRC41	Q15345	812 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	FXN	Q16595	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023		Q96M66	194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	DDAH1	O94760	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	GNAL	P38405	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	STAT3	P40763	770 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	EGR3	Q06889	387 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HFM1-208	ENST00000488023	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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