RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 TNNI3KQ59H18 835 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SGPP1Q9BX95 441 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ABLIM1O14639 778 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT1P04264 644 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 MED14OSP0DP75 135 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ERVFRD-1P60508 538 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ARID5AQ03989 594 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 APBA2Q99767 749 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 CD320Q9NPF0 282 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 AKT3Q9Y243 479 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.79□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.79□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 E9PSI1 815 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 HRKO00198 91 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 VIPR1P32241 457 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00310P59036 64 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 GRB10Q13322 594 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 TMC6Q7Z403 805 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-210ENST00000485459 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 MVKQ03426 396 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 BVESQ8NE79 360 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 TINF2Q9BSI4 451 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.77□□□□□ -1.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 RPTNQ6XPR3 784 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 IRAK3Q9Y616 596 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 FGRP09769 529 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 PAMP19021 973 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CORO7P57737 925 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 NR1I3Q14994 352 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 SV2CQ496J9 727 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CABP7Q86V35 215 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 GCM1Q9NP62 436 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 B2RBV5 119 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 EPHB3P54753 998 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 SCRN1Q12765 414 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF385BQ569K4 471 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 USP33Q8TEY7 942 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 KCTD3Q9Y597 815 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 N4BP3O15049 544 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CYBBP04839 570 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 LZTR1Q8N653 840 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 MZB1Q8WU39 189 aa6.73□□□□□ -1.33
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