RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TAF1P21675 1872 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DISP2A7MBM2 1401 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 NNTQ13423 1086 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SETDB2Q96T68 719 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ELF1P32519 619 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MECOMQ03112 1051 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CHUKO15111 745 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PAX7P23759 505 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KIF5AQ12840 1032 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF384Q8TF68 577 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 LRP6O75581 1613 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 STRCQ7RTU9 1775 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TSPY2A6NKD2 308 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 AGPSO00116 658 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SPA17Q15506 151 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP3Q96P20 1036 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 FAM184BQ9ULE4 1060 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KLC4Q9NSK0 619 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SPEF2Q9C093 1822 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TTC26A0AVF1 554 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ18B7U540 433 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ12Q14500 433 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 SHISA4Q96DD7 197 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MYH7P12883 1935 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L8P0C7I0 530 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PAFAH1B1P43034 410 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 GSCP56915 257 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 ATRNO75882 1429 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 XBP1P17861 261 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 MCM7P33993 719 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 NELFBQ8WX92 580 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 COL4A1P02462 1669 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM75PA6NK02 468 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC51Q96ER9 411 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 LACRTQ9GZZ8 138 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-204ENST00000483092 PTPREP23469 700 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP5P59047 1200 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 KRT83P78385 493 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CNPY4Q8N129 248 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TMTC2Q8N394 836 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CPVLQ9H3G5 476 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA3Q99758 1704 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS3O15072 1205 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PDHBP11177 359 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf74Q6P047 294 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM47Q96LD4 638 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MYH3P11055 1940 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 VAV2P52735 878 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM49BA6NDI0 452 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 KRT2P35908 639 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PAGE5Q96GU1 130 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC42Q96M95 316 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 AMPD2Q01433 879 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 UBE4AQ14139 1066 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms