RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480158.1

HERC4-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HERC4, Length 2,438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-210ENST00000480158 FBXO11Q86XK2 927 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-210ENST00000480158 WASF1Q92558 559 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-210ENST00000480158 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-210ENST00000480158 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-210ENST00000480158 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 STXBP3O00186 592 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 SMARCA1P28370 1054 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 VEGFBP49765 207 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 WDR78Q5VTH9 848 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 AMNQ9BXJ7 453 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 BARHL2Q9NY43 387 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 BTBD7Q9P203 1132 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 KIF3AQ9Y496 699 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 RIPK3Q9Y572 518 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 STK36Q9NRP7 1315 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 SMCO2A6NFE2 343 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 RASSF10A6NK89 507 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 XBP1P17861 261 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PDCP20941 246 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 IFNL1Q8IU54 200 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 OXER1Q8TDS5 423 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TBC1D5Q92609 795 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 MTMR8Q96EF0 704 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ZNF536O15090 1300 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 BTBD18B2RXH4 712 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PLA2G6O60733 806 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ICAM1P05362 532 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 STAT3P40763 770 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 C1QTNF8P60827 252 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 NOGQ13253 232 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 NR5A1Q13285 461 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 UBE2SQ16763 222 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 Q3C1V9 767 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PGBD1Q96JS3 809 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 CPA4Q9UI42 421 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PNMA3Q9UL41 463 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 NFIBO00712 420 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 CFBP00751 764 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ATP2B1P20020 1258 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 SREBF2Q12772 1141 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 LBX2Q6XYB7 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TMEM260Q9NX78 707 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 MTMR6Q9Y217 621 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 CENPFP49454 3210 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 KIF28PB7ZC32 967 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 MMP1P03956 469 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 DDIT3P35638 169 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 NSMFQ6X4W1 530 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 REPS2Q8NFH8 660 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 PTPRFP10586 1907 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 FAM205CA6NFA0 338 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 OPLAHO14841 1288 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TRPA1O75762 1119 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 CNMDO75829 334 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 TBC1D8O95759 1140 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 ADCY7P51828 1080 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 INHBEP58166 350 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-210ENST00000480158 CRHR2Q13324 411 aa7.37□□□□□ -1.23
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