RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 TRPV6Q9H1D0 765 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 WNT8AQ9H1J5 351 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 REV3LO60673 3130 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TMEM265A0A087WTH1 108 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TNFAIP2Q03169 654 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 EEPD1Q7L9B9 569 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 GMCL1Q96IK5 515 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PRDM12Q9H4Q4 367 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 CYP39A1Q9NYL5 469 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 XIRP2A4UGR9 3374 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 FGRP09769 529 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TSPY3P0CV98 308 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TSPY8P0CW00 308 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ALAS1P13196 640 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MYOGP15173 224 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 GNAT2P19087 354 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 SLC16A2P36021 539 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 MORC4Q8TE76 937 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 ACAD9Q9H845 621 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 FBXO40Q9UH90 709 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-206ENST00000474188 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 B4GALT4O60513 344 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G6O60733 806 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ARHGEF15O94989 841 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 SLC1A4P43007 532 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 STAT2P52630 851 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 RABGGTBP53611 331 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CCL23P55773 120 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.356e-7■■□□□ 12.3
NISCH-206ENST00000474188 RCSD1Q6JBY9 416 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 TLK2Q86UE8 772 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 HERVK_113Q902F9 699 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 VTI1AQ96AJ9 217 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 IL23AQ9NPF7 189 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 MTMR7Q9Y216 660 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 NCOR1O75376 2440 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 BDP1A6H8Y1 2624 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 NFIBO00712 420 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ITGA7Q13683 1181 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 SCLYQ96I15 445 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FAM227BQ96M60 508 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FSD1Q9BTV5 496 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 NAPBQ9H115 298 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 STX8Q9UNK0 236 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 A0A0D9SFI3 127 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 PDE4BQ07343 736 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 BTNL9Q6UXG8 535 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 OTOP2Q7RTS6 562 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FAM160B2Q86V87 743 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CHURC1Q8WUH1 139 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 PPM1EQ8WY54 764 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 COPS5Q92905 334 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ANAPC4Q9UJX5 808 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FGAP02671 866 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CYP2C9P11712 490 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 MX1P20591 662 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 TTLL4Q14679 1199 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 TKFCQ3LXA3 575 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 NSMFQ6X4W1 530 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 SLC30A10Q6XR72 485 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 SPRED2Q7Z698 418 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D5Q92609 795 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CPVLQ9H3G5 476 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 HIPK3Q9H422 1215 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 GBF1Q92538 1859 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 MROH7Q68CQ1 1323 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 EPOPA6NHQ4 379 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ASB14A6NK59 587 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 RFXAPO00287 272 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ORC4O43929 436 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ARIH2O95376 493 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ICAM1P05362 532 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 FDX1P10109 184 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 GPNMBQ14956 572 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 ALX1Q15699 326 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-206ENST00000474188 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms