RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.81■■□□□ 1.88
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USP4-208ENST00000464168 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 CSF2RAP15509 400 aa26.8■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.8■■□□□ 1.88
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USP4-208ENST00000464168 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.8■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.8■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 CD4P01730 458 aa26.79■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 NOVP48745 357 aa26.79■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 RASIP1Q5U651 963 aa26.79■■□□□ 1.88
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USP4-208ENST00000464168 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.79■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 TMEM199Q8N511 208 aa26.79■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.79■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 CYP39A1Q9NYL5 469 aa26.79■■□□□ 1.88
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USP4-208ENST00000464168 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 ORC4O43929 436 aa26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 CABYRO75952 493 aa26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 FGRP09769 529 aa26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 CYP2C18P33260 490 aa26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 MTMR7Q9Y216 660 aa26.76■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 GRIN2DO15399 1336 aa26.75■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 ALX1Q15699 326 aa26.75■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.75■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 ICAM1P05362 532 aa26.74■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 ITGA7Q13683 1181 aa26.74■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.74■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 PBX4Q9BYU1 374 aa26.74■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 Q9Y3F1 56 aa26.74■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 SLC16A2P36021 539 aa26.73■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 HIPK3Q9H422 1215 aa26.72■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 VTA1Q9NP79 307 aa26.72■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.72■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 HERVK_113Q902F9 699 aa26.71■■□□□ 1.87
USP4-208ENST00000464168 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.71■■□□□ 1.87
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USP4-208ENST00000464168 PDE1AP54750 535 aa26.7■■□□□ 1.86
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USP4-208ENST00000464168 FAM227BQ96M60 508 aa26.7■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.7■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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USP4-208ENST00000464168 MYO9BQ13459 2157 aa26.69■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.69■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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USP4-208ENST00000464168 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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USP4-208ENST00000464168 B4GALT4O60513 344 aa26.68■■□□□ 1.86
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USP4-208ENST00000464168 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.68■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.68■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.68■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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USP4-208ENST00000464168 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 A0A0D9SFI3 127 aa26.67■■□□□ 1.86
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