RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 CYP4F3Q08477 520 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 DUSP4Q13115 394 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 KSR1Q8IVT5 923 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 COPS5Q92905 334 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 MAP6Q96JE9 813 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CDC6Q99741 560 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 ERVFC1P60507 584 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 FZD5Q13467 585 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 C2orf27AQ580R0 203 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 NSMFQ6X4W1 530 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CLEC1BQ9P126 229 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 PAX4O43316 350 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 DLX3O60479 287 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CPP00450 1065 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 FGFR1P11362 822 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 PLS3P13797 630 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 L1CAMP32004 1257 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 LAPTM5Q13571 262 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 FAM209AQ5JX71 171 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 MCTP1Q6DN14 999 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 FRS2Q8WU20 508 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 OSBP2Q969R2 916 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CCDC120Q96HB5 630 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 EXOC2Q96KP1 924 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CCDC140Q96MF4 163 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-211ENST00000426951 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D8O95759 1140 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SCG5P05408 212 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 PAMP19021 973 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 GDNFP39905 211 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 RTP1P59025 263 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SLC14A2Q15849 920 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 OXR1Q8N573 874 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 JMYQ8N9B5 988 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 C1orf159Q96HA4 380 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ESYT3A0FGR9 886 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 BLACEA4D250 179 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 CHRNEQ04844 493 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 MAP4K2Q12851 820 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SQSTM1Q13501 440 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 JAMLQ86YT9 394 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 JMJD8Q96S16 334 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TLDC2A0PJX2 215 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 FITM1A5D6W6 292 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ARNTLO00327 626 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 HPXP02790 462 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 RAC2P15153 192 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 USP53Q70EK8 1073 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms