RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ESYT2A0FGR8 921 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 N4BP3O15049 544 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 RHOBTB3O94955 611 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 GYPCP04921 128 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 UBA7P41226 1012 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 STIM1Q13586 685 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 JAG2Q9Y219 1238 aa26.76■■□□□ 1.88
PMS1-205ENST00000409985 KLRF2D3W0D1 207 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 NFKBIEO00221 500 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CDK8P49336 464 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 STAMQ92783 540 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 WDR24Q96S15 920 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 THAP9Q9H5L6 903 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 GAKO14976 1311 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ18B7U540 433 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 C6orf229H3BNL8 230 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 BTDP43251 543 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PRELPP51888 382 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ12Q14500 433 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 EYA3Q99504 573 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 C6orf50Q9HD87 102 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PQC6 194 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CASP14P31944 242 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PRCPP42785 496 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CARD6Q9BX69 1037 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 MYO1AQ9UBC5 1043 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 STX8Q9UNK0 236 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 COL4A5P29400 1685 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 GRIK5Q16478 980 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 INF2Q27J81 1249 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 TEX11Q8IYF3 940 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 KLRC4O43908 158 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 KIF5CO60282 957 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RIMBP2O15034 1052 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CLCN6P51797 869 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF446Q9NWS9 450 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 FOCADQ5VW36 1801 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PSMA7O14818 248 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 OR52Z1P0C646 297 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RHBDL3P58872 404 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PPP2R3AQ06190 1150 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RABGGTAQ92696 567 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 PSMD1Q99460 953 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 FLT1P17948 1338 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 NAPAP54920 295 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 RASSF7Q02833 373 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 MTF1Q14872 753 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 DESI2Q9BSY9 194 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-205ENST00000409985 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.865e-9■□□□□ 10.7
PMS1-205ENST00000409985 IRF2BP1Q8IU81 584 aa26.7■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.7■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.7■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 GDAQ9Y2T3 454 aa26.7■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 LGALS16A8MUM7 142 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 AMPD3Q01432 767 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 SOGA3Q5TF21 947 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 TMCO3Q6UWJ1 677 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 NEK8Q86SG6 692 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 SMCO2A6NFE2 343 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 AOC3Q16853 763 aa26.68■■□□□ 1.86
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