RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K11Q16584 847 aa23.16■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 CSADQ9Y600 493 aa23.16■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 POTEJP0CG39 1038 aa23.15■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 GRIN1Q05586 938 aa23.15■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 HMGCS2P54868 508 aa23.15■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.15■■□□□ 1.3
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HDDC3-202ENST00000394272 FERMT2Q96AC1 680 aa23.14■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.14■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 USP17L11C9JVI0 530 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L18D6R9N7 530 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L22D6RA61 530 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L19D6RCP7 530 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 USP17L20D6RJB6 530 aa23.13■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF536O15090 1300 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 EDIL3O43854 480 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 FLOT1O75955 427 aa23.13■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 MOB2Q70IA6 237 aa23.13■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.11■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.11■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 LAD1O00515 517 aa23.1■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 PPATQ06203 517 aa23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 CAMK4Q16566 473 aa23.1■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 ELP3Q9H9T3 547 aa23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.1■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ABCB11O95342 1321 aa23.1■■□□□ 1.29
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HDDC3-202ENST00000394272 FDX1P10109 184 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 IL17AQ16552 155 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 SPECC1Q5M775 1068 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ERO1BQ86YB8 467 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ANO3Q9BYT9 981 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF202O95125 648 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.09■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 SYKP43405 635 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.08■■□□□ 1.29
HDDC3-202ENST00000394272 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-202ENST00000394272 TRAF5O00463 557 aa23.07■■□□□ 1.28
HDDC3-202ENST00000394272 IRF6O14896 467 aa23.07■■□□□ 1.28
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