RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 SCYL1Q96KG9 808 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 P4HA1P13674 534 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF827Q17R98 1081 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 TEKT1Q969V4 418 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 CLIC4Q9Y696 253 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 CREB3O43889 395 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 GPBP1Q86WP2 473 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 ATP5JP18859 108 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0D9SFI3 127 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRT-204ENST00000373190 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 TNNI1P19237 187 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 PTH1RQ03431 593 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 SPATA5Q8NB90 893 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 CDKL2Q92772 493 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-204ENST00000373190 SLC1A4P43007 532 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 NME8Q8N427 588 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 JAG2Q9Y219 1238 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 DTNBO60941 627 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 CUEDC2Q9H467 287 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 CA8P35219 290 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 USP19O94966 1318 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 TECP42680 631 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 PTGDRQ13258 359 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 ABCB6Q9NP58 842 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 CLIC6Q96NY7 704 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-204ENST00000373190 PRDM1O75626 825 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRT-204ENST00000373190 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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