RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HECTD2Q5U5R9 776 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAQR3Q6TCH7 311 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLNQ7Z5Q5 900 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM50Q86XT4 487 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CPA5Q8WXQ8 436 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRFN3Q9BTN0 628 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELP3Q9H9T3 547 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDH18Q9HCL0 1135 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPRC5BQ9NZH0 403 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM63CQ9P1W3 806 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ICKQ9UPZ9 632 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A096LPE4 126 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PPZ6 126 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRID2IPA4D2P6 1211 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 METTL12A8MUP2 240 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FANCGO15287 622 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRGAP3O43295 1099 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRG2P13727 222 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRGPREQ86SM8 312 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FUKQ8N0W3 1084 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RIN3Q8TB24 985 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALG3Q92685 438 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMF1Q96S06 567 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM168Q9H0V1 697 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PICK1Q9NRD5 415 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACSL6Q9UKU0 697 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PROCRQ9UNN8 238 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAD17O75943 681 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CELA3AP09093 270 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EDN3P14138 238 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PMLP29590 882 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP1A2P50993 1020 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR5P85299 388 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR31Q5SQ13 230 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYB5RLQ6IPT4 315 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WAPLQ7Z5K2 1190 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMPRSS6Q8IU80 811 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTLL6Q8N841 843 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KYQ8NBH2 561 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUP43Q8NFH3 380 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBPJLQ9UBG7 517 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CGB1A6NKQ9 187 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B3GALT2O43825 422 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DBHP09172 617 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYP2C8P10632 490 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGFBP4P22692 258 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RFC5P40937 340 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU4F1Q01851 419 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPM1JQ5JR12 505 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB37Q5TC79 503 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AWAT2Q6E213 333 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF438Q7Z4V0 828 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAX1BP1Q86VP1 789 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FRS2Q8WU20 508 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HAS1Q92839 578 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC37BQ96QE4 947 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GORASP1Q9BQQ3 440 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA1024Q9UPX6 916 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MDN1Q9NU22 5596 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FADS2P1A8MWK0 482 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS6KA4O75676 772 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMNB1P20700 586 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAP2P40123 477 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DDR1Q08345 913 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTPAQ15257 358 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C11orf87Q6NUJ2 197 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C18orf65Q6ZTR6 163 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF507Q8TCN5 953 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNH3Q9ULD8 1083 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms