RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF202O95125 648 aa22.87■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 IQCB1Q15051 598 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 SULF1Q8IWU6 871 aa22.87■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 HPSEQ9Y251 543 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.86■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.86■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 USP14P54578 494 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 SNAP25P60880 206 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.85■■□□□ 1.25
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SUMO3-201ENST00000332859 SARM1Q6SZW1 724 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 PTPRAP18433 802 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF75DP51815 510 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 GRIN1Q05586 938 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 TBCKQ8TEA7 893 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 KIFC2Q96AC6 838 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 CSRNP2Q9H175 543 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-201ENST00000332859 CDC25BP30305 580 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 UBE2SQ16763 222 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 ADM5C9JUS6 153 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 LAD1O00515 517 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 MTMR2Q13614 643 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USH1GQ495M9 461 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 MCTP2Q6DN12 878 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.82■■□□□ 1.24
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SUMO3-201ENST00000332859 TRIM5Q9C035 493 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 BECN2A8MW95 431 aa22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 LETM2Q2VYF4 491 aa22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.242e-21■■■■■ 37.2
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SUMO3-201ENST00000332859 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 SPP2Q13103 211 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 SPECC1Q5M775 1068 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 BACE1P56817 501 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.8■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 SCN4AP35499 1836 aa22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 NLRP12P59046 1061 aa22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 AP3B2Q13367 1082 aa22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.79■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 VCAM1P19320 739 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 PRPHP41219 470 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 PRKG1Q13976 671 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC174Q6PII3 467 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L15C9J2P7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 C19orf81C9J6K1 198 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L11C9JVI0 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L18D6R9N7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L22D6RA61 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L19D6RCP7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 USP17L20D6RJB6 530 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 NEMFO60524 1076 aa22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SUMO3-201ENST00000332859 MAP3K9P80192 1104 aa22.78■■□□□ 1.24
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