RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 AKT3Q9Y243 479 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SCRN1Q12765 414 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM58Q8NG06 486 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 P3H4Q92791 437 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A2P36021 539 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PLXNC1O60486 1568 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TMOD1P28289 359 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CNKSR1Q969H4 720 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 FANCLQ9NW38 375 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT6Q14141 434 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 LTKP29376 864 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MYL7Q01449 175 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ERFEQ4G0M1 354 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MCTP2Q6DN12 878 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC51Q96ER9 411 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PHBP35232 272 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PLCB4Q15147 1175 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 NAA35Q5VZE5 725 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 IQCDQ96DY2 449 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 XDHP47989 1333 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF3Q9H094 633 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ODR4Q5SWX8 454 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRTO14522 1441 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 KIF11P52732 1056 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD2Q14681 263 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 CEP120Q8N960 986 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP24Q8N264 748 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PDE8BO95263 885 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R5AQ15172 486 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PPFIA1Q13136 1202 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 CMA1P23946 247 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MTMR6Q9Y217 621 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 H0YCG3 227 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT17Q6IS24 598 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MIPOL1Q8TD10 442 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 GSTA1P08263 222 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 GSTA2P09210 222 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 THAP12O43422 761 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 BFSP1Q12934 665 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 HAUS1Q96CS2 278 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 H7C0C1 242 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5OP48047 213 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 VCXQ9H320 206 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 PKP1Q13835 747 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 RFX6Q8HWS3 928 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 DCLK2Q8N568 766 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 A6NJR5 290 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-201ENST00000332175 ATF2P15336 505 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms