RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 SNAPC2Q13487 334 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 TREML2Q5T2D2 321 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 ATG4CQ96DT6 458 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 WNK4Q96J92 1243 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 ZNF536O15090 1300 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 ABCB11O95342 1321 aa22.53■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 PASKQ96RG2 1323 aa22.53■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.53■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.52■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 MOGSQ13724 837 aa22.51■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 STK38Q15208 465 aa22.51■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.51■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 SLC39A14Q15043 492 aa22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 UBE2SQ16763 222 aa22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 REPS2Q8NFH8 660 aa22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.5■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 PIK3CDO00329 1044 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 MEIS2O14770 477 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 ATP2A1O14983 1001 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 GTF2A2P52657 109 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 AP3B2Q13367 1082 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 PTPAQ15257 358 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TTC38Q5R3I4 469 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 CPXCR1Q8N123 301 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM260Q9NX78 707 aa22.49■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 INF2Q27J81 1249 aa22.48■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 MB21D1Q8N884 522 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 JMYQ8N9B5 988 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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CCDC71-201ENST00000321895 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TBCKQ8TEA7 893 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TRAK2O60296 914 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 PPP6R2O75170 966 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 MBD3O95983 291 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 ALAS1P13196 640 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 ME1P48163 572 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 NEK8Q86SG6 692 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 WNT7AO00755 349 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 POLR2MP0CAP2 368 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 OSBPP22059 807 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 PGBD1Q96JS3 809 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.45■■□□□ 1.19
CCDC71-201ENST00000321895 TOMM70O94826 608 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 CFBP00751 764 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC71-201ENST00000321895 GHRHRQ02643 423 aa22.45■■□□□ 1.18
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