RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.42□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.42□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB14O75071 495 aa9.41□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf60Q5U649 245 aa9.41□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.41□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 NYAP2Q9P242 653 aa9.41□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.39□□□□□ -0.91
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PGGT1B-201ENST00000296642 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PIEZO1Q92508 2521 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 CTAGE5O15320 804 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCY6O43306 1168 aa9.38□□□□□ -0.91
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