RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289672.6

PKD1L1-201, Transcript of polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1L1, Length 9,092 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L1-201ENST00000289672 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 OLFM3Q96PB7 478 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 KRT19P08727 400 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 NR1H3Q13133 447 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MED21Q13503 144 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MAPK13O15264 365 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 BFSP1Q12934 665 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 GUCY2FP51841 1108 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PLXNC1O60486 1568 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TBCCQ15814 346 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ST7Q9NRC1 585 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SUFUQ9UMX1 484 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 OCM2P0CE71 109 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ZNF174Q15697 407 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SSH2Q76I76 1423 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 NLRX1Q86UT6 975 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 FANCAO15360 1455 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 CPP00450 1065 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PAMP19021 973 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 CUEDC2Q9H467 287 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SUN2Q9UH99 717 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 KCNJ18B7U540 433 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 GAS7O60861 476 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 KCNJ12Q14500 433 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 HOMEZQ8IX15 550 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 KLHL29Q96CT2 875 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MPP6Q9NZW5 540 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 IFT88Q13099 833 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 CUL1Q13616 776 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 RCN2Q14257 317 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ATP8B3O60423 1300 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 GSNP06396 782 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SPDYE6P0CI01 402 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 STK17AQ9UEE5 414 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 POLD1P28340 1107 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 IL1RL1Q01638 556 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SP4Q02446 784 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.48□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MSH6P52701 1360 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 LAD1O00515 517 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 SKOR1P84550 965 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TLK1Q9UKI8 766 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ITKQ08881 620 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 FSCBQ5H9T9 825 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MTRQ99707 1265 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ATP1A2P50993 1020 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ZBTB18Q99592 522 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 DCTPP1Q9H773 170 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 PMLP29590 882 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MTX1Q13505 466 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MYL1P05976 194 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MSH2P43246 934 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 LIG3P49916 1009 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TEX11Q8IYF3 940 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MED10Q9BTT4 135 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 RASSF10A6NK89 507 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 MEIS1O00470 390 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 DEPTORQ8TB45 409 aa9.47□□□□□ -0.89
PKD1L1-201ENST00000289672 EXOC4Q96A65 974 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms