RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
UFD1-201ENST00000263202 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.95■■□□□ 1.75
UFD1-201ENST00000263202 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.95■■□□□ 1.75
UFD1-201ENST00000263202 ATG4CQ96DT6 458 aa25.95■■□□□ 1.75
UFD1-201ENST00000263202 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.95■■□□□ 1.75
UFD1-201ENST00000263202 TMEM260Q9NX78 707 aa25.95■■□□□ 1.75
UFD1-201ENST00000263202 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.95■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.95■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 VWA5AO00534 786 aa25.94■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 OPLAHO14841 1288 aa25.94■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 UBE2SQ16763 222 aa25.94■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.94■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 WNK4Q96J92 1243 aa25.94■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 MYPNQ86TC9 1320 aa25.94■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 KIF3CO14782 793 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 ZBED4O75132 1171 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 ATP2B1P20020 1258 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 TRAPPC10P48553 1259 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 MOGSQ13724 837 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 SLC39A14Q15043 492 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 STK38Q15208 465 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 PTPAQ15257 358 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 ABCB11O95342 1321 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 WNT7AO00755 349 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 TRAK2O60296 914 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 UBE2HP62256 183 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.93■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 MEIS2O14770 477 aa25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 TTC38Q5R3I4 469 aa25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 REPS2Q8NFH8 660 aa25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 SPTLC2O15270 562 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 SNAPC2Q13487 334 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 INF2Q27J81 1249 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 CPXCR1Q8N123 301 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 PGBD1Q96JS3 809 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 PASKQ96RG2 1323 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 GPT2Q8TD30 523 aa25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 TBCKQ8TEA7 893 aa25.89■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 PNMA2Q9UL42 364 aa25.89■■□□□ 1.74
UFD1-201ENST00000263202 PIK3CDO00329 1044 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ZNF174Q15697 407 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 PPP6R2O75170 966 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ME1P48163 572 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 OAZ1P54368 228 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 HUNKP57058 714 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MBD3O95983 291 aa25.87■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 AP3B2Q13367 1082 aa25.87■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.87■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MCTP2Q6DN12 878 aa25.87■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.87■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ATP2A1O14983 1001 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ALAS1P13196 640 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 SPRYD7Q5W111 196 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 NEK8Q86SG6 692 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 TBC1D5Q92609 795 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 CFBP00751 764 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 GTF2A2P52657 109 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 JMYQ8N9B5 988 aa25.86■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 BMP15O95972 392 aa25.85■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 CETPP11597 493 aa25.85■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MCM7P33993 719 aa25.85■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
UFD1-201ENST00000263202 ANO3Q9BYT9 981 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms