RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 P2RX5Q93086 422 aa24.76■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 BICDL2A1A5D9 508 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.76■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 PNMA1Q8ND90 353 aa24.76■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.75■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 C8orf37Q96NL8 207 aa24.75■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 AK8Q96MA6 479 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.74■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.73■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB9Q96C00 473 aa24.73■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 MIIPQ5JXC2 388 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC31Q6UY01 552 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 PLIN2Q99541 437 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.73■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 BARHL2Q9NY43 387 aa24.73■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.73■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 KLK7P49862 253 aa24.72■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 C12orf60Q5U649 245 aa24.71■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.71■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM66O15016 1216 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 CYTH3O43739 400 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 USP17L8P0C7I0 530 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.71■■□□□ 1.55
HTATSF1-201ENST00000218364 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.71■■□□□ 1.55
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HTATSF1-201ENST00000218364 KIF5AQ12840 1032 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 STK4Q13043 487 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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HTATSF1-201ENST00000218364 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.7■■□□□ 1.54
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HTATSF1-201ENST00000218364 CAGE1Q8TC20 777 aa24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF263O14978 683 aa24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNRD1Q16881 649 aa24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 RUBCNQ92622 972 aa24.69■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52Z1P0C646 297 aa24.68■■□□□ 1.54
HTATSF1-201ENST00000218364 MYBL2P10244 700 aa24.68■■□□□ 1.54
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