RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 FTCDO95954 541 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 NELFCDQ8IXH7 590 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TJP1Q07157 1748 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 LGALS16A8MUM7 142 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT14P02533 472 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 NAPAP54920 295 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 SPAG1Q07617 926 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 PDCLQ13371 301 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 MUM1L1Q5H9M0 696 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TNFRSF25Q93038 417 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 GRIK5Q16478 980 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CABP7Q86V35 215 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 ARL8AQ96BM9 186 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP2C2O75185 946 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPY3P0CV98 308 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPY8P0CW00 308 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 GPATCH11Q8N954 259 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 BCAS4Q8TDM0 211 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 HAUS4Q9H6D7 363 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 H7C1D1 291 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 GNGT1P63211 74 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 ITPK1Q13572 414 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 RASSF10A6NK89 507 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 MARCH6O60337 910 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 RUFY1Q96T51 708 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 SALL4Q9UJQ4 1053 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 POTEMA6NI47 508 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXW10Q5XX13 1052 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM76AQ8TAV0 307 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC51Q96ER9 411 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 RMND1Q9NWS8 449 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CYTH3O43739 400 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 HPDP32754 393 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL7Q8IXQ5 586 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.34■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 COA7Q96BR5 231 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 MYH10P35580 1976 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNQ1-201ENST00000155840 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 PCDHA6Q9UN73 950 aa19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.33■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 IVLP07476 585 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT83P78385 493 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 F8W031 263 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 AGPSO00116 658 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 RCSD1Q6JBY9 416 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 POTEDQ86YR6 584 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 UTRNP46939 3433 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC53A6NM62 1247 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 CAPN11Q9UMQ6 739 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 NFU1Q9UMS0 254 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 KLRC4O43908 158 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGEA1P43355 309 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 TTI2Q6NXR4 508 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 P2RX5Q93086 422 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 NUDT12Q9BQG2 462 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM153BP0C7A2 387 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC1A4P43007 532 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 DNM2P50570 870 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM153CQ494X1 144 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM153AQ9UHL3 310 aa19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms