RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SYP	P08247	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CD8B	P10966	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CD96	P40200	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	GRIA2	P42262	883 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	GFRA1	P56159	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	AMPD2	Q01433	879 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	EGR3	Q06889	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	COPS5	Q92905	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CD3E	P07766	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	IFNGR1	P15260	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	LTK	P29376	864 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	HOXC12	P31275	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	IKZF1	Q13422	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TESK1	Q15569	626 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	STXBP3	O00186	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	DLX3	O60479	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FUT4	P22083	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SCRN1	Q12765	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	LRP8	Q14114	963 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PRODH	O43272	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CP	P00450	1065 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	GSTM1	P09488	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ZP2	Q05996	745 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	APPBP2	Q92624	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ARNTL	O00327	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FKTN	O75072	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CDC45	O75419	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	THBD	P07204	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.9 ms