RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PHKB	Q93100	1093 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	XDH	P47989	1333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	USP17L21	D6R901	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PRR16	Q569H4	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TSC1	Q92574	1164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	INPP5B	P32019	993 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CIAO1	O76071	339 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CYP2J2	P51589	502 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	APBA1	Q02410	837 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	BTD	P43251	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TTC1	Q99614	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015		A6NJR5	290 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	STX2	P32856	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MFAP3	P55082	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF445	P59923	1031 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ASPH	Q12797	758 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	BRD3	Q15059	726 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	AK8	Q96MA6	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PFKFB2	O60825	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CPA1	P15085	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PHKG2	P15735	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MORC3	Q14149	939 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RILP	Q96NA2	401 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	WDR62	O43379	1518 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	NFKBIA	P25963	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PTK2	Q05397	1052 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PDE6A	P16499	860 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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