RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624951.1

CU633980.2-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CU633980.2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.2-201ENST00000624951 NEK4P51957 841 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 PPP2R5BQ15173 497 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 RABEP1Q15276 862 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 RTN1Q16799 776 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 Q3C1V9 767 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 IL27Q8NEV9 243 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 KIF2CQ99661 725 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 SPZ1Q9BXG8 430 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 CPVLQ9H3G5 476 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 PNMA2Q9UL42 364 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 MYH6P13533 1939 aa13.15□□□□□ -0.3
CU633980.2-201ENST00000624951 PLXNB2O15031 1838 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ICAM1P05362 532 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SMARCA1P28370 1054 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CCDC174Q6PII3 467 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TRIM47Q96LD4 638 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PORCNQ9H237 461 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 MROH8Q9H579 483 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 EFCC1Q9HA90 598 aa13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNF536O15090 1300 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ERCC3P19447 782 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CTGFP29279 349 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 AK2P54819 239 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SNAP25P60880 206 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TKFCQ3LXA3 575 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CPXCR1Q8N123 301 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 COA7Q96BR5 231 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 MTMR8Q96EF0 704 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RIOX1Q9H6W3 641 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.13□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CYTH3O43739 400 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 HOXD10P28358 340 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PRMT2P55345 433 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CAP1Q01518 475 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 WDR78Q5VTH9 848 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 OTOP1Q7RTM1 612 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 GPR142Q7Z601 462 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 NBPF11Q86T75 865 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CHST13Q8NET6 341 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 AGBL1Q96MI9 1066 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 FBXO40Q9UH90 709 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.12□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SLC15A5A6NIM6 579 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ZBTB5O15062 677 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 STRNO43815 780 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TRAF1Q13077 416 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 HOMER1Q86YM7 354 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ACAD9Q9H845 621 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RNF146Q9NTX7 359 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 SRRDQ9UH36 339 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 RIPK3Q9Y572 518 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 TRIM17Q9Y577 477 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ABCB11O95342 1321 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.11□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ST18O60284 1047 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 FCER1AP12319 257 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 ALAS1P13196 640 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 PTPREP23469 700 aa13.1□□□□□ -0.31
CU633980.2-201ENST00000624951 CDC27P30260 824 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms