RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599687.1

SNRNP70-208, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70, human

TSL 2

Gene SNRNP70, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP70-208	ENST00000599687	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SNRNP70-208	ENST00000599687	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SNRNP70-208	ENST00000599687	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SNRNP70-208	ENST00000599687	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SNRNP70-208	ENST00000599687	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	BACH1	O14867	736 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	VGLL4	Q14135	290 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RNF34	Q969K3	372 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CAPN10	Q9HC96	672 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	STIM2	Q9P246	746 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ENTPD3	O75355	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	LDHC	P07864	332 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	BTD	P43251	543 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	FGD1	P98174	961 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RAI14	Q9P0K7	980 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	INHA	P05111	366 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RGS3	P49796	1198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RHBDL3	P58872	404 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	GSTO1	P78417	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	DGKZ	Q13574	1117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	PTPN18	Q99952	460 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	GPR25	O00155	361 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZBTB39	O15060	712 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	INPP5B	P32019	993 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF76	P36508	570 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZAP70	P43403	619 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ATCAY	Q86WG3	371 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	HMMR	O75330	724 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	GTF2A2	P52657	109 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	FOXK2	Q01167	660 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	AACS	Q86V21	672 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNRNP70-208	ENST00000599687	CYLD	Q9NQC7	956 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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