RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597243.5

LINC01435-209, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1435, humanhuman

TSL 5

Gene LINC01435, Length 712 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01435-209ENST00000597243 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 MYH1P12882 1939 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 ELP1O95163 1332 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 PRDM1O75626 825 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 CYP2D6P10635 497 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 RASA1P20936 1047 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 CDC27P30260 824 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 TNNI2P48788 182 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 HIC1Q14526 733 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 GALNT17Q6IS24 598 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FAM83AQ86UY5 434 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FAM151AQ8WW52 585 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 HOOK2Q96ED9 719 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 ALG1Q9BT22 464 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 BCS1LQ9Y276 419 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 FOCADQ5VW36 1801 aa6.71□□□□□ -1.33
LINC01435-209ENST00000597243 YDJCA8MPS7 323 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PSMD14O00487 310 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TTLL1O95922 423 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CALML3P27482 149 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CXCL9Q07325 125 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 RESTQ13127 1097 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PICALMQ13492 652 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 NBPF11Q86T75 865 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 SLC51AQ86UW1 340 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PNMA1Q8ND90 353 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 MKL1Q969V6 931 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 SPATA32Q96LK8 384 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CABP5Q9NP86 173 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 GINM1Q9NU53 330 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 LAMB1P07942 1786 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PSME4Q14997 1843 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 H7C1D1 291 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 FZD9O00144 591 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 RAD17O75943 681 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 UPP2O95045 317 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 YEATS4O95619 227 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TRAF1Q13077 416 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TNFAIP1Q13829 316 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 GRM4Q14833 912 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 KRT40Q6A162 431 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 JMYQ8N9B5 988 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 MXD3Q9BW11 206 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 NYAP2Q9P242 653 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 STX8Q9UNK0 236 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-209ENST00000597243 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms