RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SMCO2A6NFE2 343 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 FIBPO43427 364 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RTEL1Q9NZ71 1219 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO11Q86XK2 927 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA32Q96LK8 384 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SLF1Q9BQI6 1058 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R2N6 131 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGCS2P54868 508 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 COA7Q96BR5 231 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 USP28Q96RU2 1077 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA2Q9UL42 364 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SMCHD1A6NHR9 2005 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL11O14625 94 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 KIFC2Q96AC6 838 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 ELP3Q9H9T3 547 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RCOR1Q9UKL0 485 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF5O00463 557 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 YEATS4O95619 227 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIL2Q13356 520 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CHADLQ6NUI6 762 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 TANGO6Q9C0B7 1094 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC10P48553 1259 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NASPP49321 788 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY7P51828 1080 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 GDPD2Q9HCC8 539 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 RIC8AQ9NPQ8 531 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 NBR1Q14596 966 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB2Q70IA6 237 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CUL5Q93034 780 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO1Q5XXA6 986 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT25Q7Z3Z0 450 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CLMNQ96JQ2 1002 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO28Q9NVF7 368 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNH4Q9UQ05 1017 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 MYPNQ86TC9 1320 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 FLOT1O75955 427 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 MCTP2Q6DN12 878 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA6Q9UN73 950 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf69Q8N8R5 385 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF408Q9H9D4 720 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L15C9J2P7 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L13C9JLJ4 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L11C9JVI0 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L18D6R9N7 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L22D6RA61 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L17D6RBQ6 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L19D6RCP7 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L20D6RJB6 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2HP62256 183 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L24Q0WX57 530 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNG4Q8TDN1 519 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD5Q96G74 571 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3O95983 291 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKZQ13574 1117 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00301Q8NCQ3 95 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 PSTPIP2Q9H939 334 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP131Q9UPN4 1083 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF6O14896 467 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 STK38Q15208 465 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC10A4Q96EP9 437 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH7BA7E2Y1 1941 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP15O95972 392 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ICAM1P05362 532 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 COG2Q14746 738 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC39A14Q15043 492 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 OPTNQ96CV9 577 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CLIC4Q9Y696 253 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCB11O95342 1321 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAK2O60296 914 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CELF2O95319 508 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 JMYQ8N9B5 988 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa35.48■■■■□ 3.27
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